Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms