Protein–RNA interactions for Protein: Q6DT37

CDC42BPG, Serine/threonine-protein kinase MRCK gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPGQ6DT37 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42BPGQ6DT37 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42BPGQ6DT37 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42BPGQ6DT37 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42BPGQ6DT37 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms