Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms