Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM46CQ5VWP2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms