Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms