Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM69BQ5VUD6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms