Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms