Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms