Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1TD1Q5T7N2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms