Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4BQ5PRF9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms