Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms