Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms