Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms