Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q56UQ5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q56UQ5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q56UQ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q56UQ5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms