Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms