Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms