Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms