Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF8Q3BBV2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms