Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms