Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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