Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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