Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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