Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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