Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF13Q15543 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms