Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SEC23BQ15437 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SEC23BQ15437 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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SEC23BQ15437 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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SEC23BQ15437 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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