Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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