Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms