Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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