Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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