Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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