Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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