Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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ZNF235Q14590 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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ZNF235Q14590 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF235Q14590 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms