Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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