Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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NCOA4Q13772 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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NCOA4Q13772 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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NCOA4Q13772 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCOA4Q13772 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCOA4Q13772 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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