Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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