Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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