Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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