Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRJQ12913 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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