Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
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