Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms