Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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