Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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