Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms