Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD47Q08722 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms