Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms