Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms