Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms