Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms