Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH6A1Q02252 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH6A1Q02252 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms