Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNC1Q01954 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms